Diferența cheie între endoteliu și mezoteliu este că endoteliul este stratul celular epitelial scuamos simplu care acoperă întregul sistem circulator, inclusiv vasele de sânge, vasele limfatice și inima, în timp ce mezoteliul este stratul celular epitelial scuamos simplu care acoperă cavitățile corpului majore, cum ar fi peritoneul, pleura și pericardul.
Epiteliul, mezoteliul și endoteliul sunt trei tipuri de straturi celulare care acoperă organele noastre interne, cavitățile corpului și pielea. Prin urmare, toate sunt bariere de protecție ale corpului. Structural, mezoteliul și endoteliul sunt straturi epiteliale specializate sau modificate cu origine mezodermică. În consecință, acestea sunt alcătuite din celule epiteliale scuamoase simple. Atât mezoteliul, cât și endoteliul sunt țesuturi cu un singur strat. Acoperă anumite suprafețe interne.