Diferența cheie între digestia în stomac și digestia în intestin este tipul de digestie care are loc. În stomac, digestia chimică și mecanică a alimentelor are loc, în timp ce, în intestin, are loc doar digestia chimică.
Digestia este procesul prin care animalele absorb nutrienții după ingestia de alimente. Digestia implică atât procese chimice, cât și mecanice. Sistemul digestiv al organismelor de nivel superior, cum ar fi oamenii, cuprinde diferite organe. Fiecare dintre aceste organe are un rol major de jucat în procesul de digestie. Digestia în stomac se referă atât la digestia chimică, cât și la cea mecanică a alimentelor care au loc în abdomen sau stomac. Digestia în intestin se referă la procesele de digestie chimică care au loc în intestinul subțire. După digestie, produsele de degradare se absorb și în fluxul sanguin și prin intestinul subțire.