Diferența cheie între genele complementare și cele complementare este că genele complementare necesită prezența fiecărei gene în exprimarea trăsăturii, în timp ce doar o genă din cele două gene suplimentare necesită prezența celeilalte gene atunci când exprimă trăsătura.
Genele interacționează între ele atunci când produc o trăsătură la un individ. Aceste interacțiuni sunt complexe și necesită o analiză aprofundată pentru a înțelege modul în care funcționează împreună și modul în care prezența genelor afectează expresia trăsăturilor. Genele complementare și complementare sunt două astfel de tipuri de gene care interacționează între ele atunci când produc o trăsătură. Acestea prezintă interacțiuni genice epistatice, ceea ce înseamnă că efectul unei gene depinde de prezența celeilalte gene.