Diferența cheie între histopatologie și citologie este că histopatologia este studiul țesuturilor bolnave folosind un microscop, în timp ce citologia este studiul celulelor individuale ale corpului.
Celulele sunt unitățile structurale de bază ale vieții. În timpul diagnosticării bolilor în medicină, celulele și țesuturile întregi sunt examinate de patologi. Studiul țesuturilor în raport cu boala este cunoscut sub numele de histopatologie. În schimb, studiul unui singur tip de celulă este cunoscut sub numele de citologie. Prin urmare, histopatologia privește țesuturile, în timp ce citologia privește celulele individuale.