Diferența cheie între diferențiere și morfogeneză este că diferențierea descrie modul în care celulele devin specializate pentru a îndeplini funcții unice, în timp ce morfogeneza descrie dezvoltarea formelor organismelor vii.
Organismele pluricelulare își încep viața dintr-o celulă, fie formează un spor, fie un zigot. Prin urmare, diferențierea celulară și morfogeneza sunt două procese diferite și majore care apar în timpul dezvoltării unui organism multicelular. Diferențierea este procesul de formare a diferitelor tipuri de celule specializate. Aceasta duce la maturarea celulelor și a țesuturilor care îndeplinesc funcții specifice pentru un organism. Pe de altă parte, morfogeneza este procesul de dezvoltare a diferitelor forme de organisme vii. Determină forma celulelor, țesuturilor, organelor sau organismelor.
