Diferența cheie între ciclohexanul și ciclohexanul trans este că ciclohexanul cis are substituenții săi îndreptându-se către același plan al inelului în timp ce ciclohexanul trans are substituenții săi îndreptați spre planuri opuse.
Ciclohexanul este un cicloalcan în care există un inel de carbon cu șase membri care există în conformația scaunului. În configurația scaunului, acest compus are cea mai mică încordare a unghiului; astfel, este mai stabil decât alte posibile conformații. Mai mult, în această conformație, jumătate din atomii de hidrogen conectați la atomii de carbon se află în planul inelului. Numim asta ca poziționare ecuatorială. Cealaltă jumătate este situată perpendicular pe planul inelului. Numim aceasta poziționare axială. Când există doi sau mai mulți substituenți în ciclohexan, putem observa izomerismul cis și trans observând dacă substituenții sunt în poziție ecuatorială sau în poziție axială.
