Diferența esențială între fața Cis și Trans a aparatului Golgi este că fața Cis a aparatului Golgi este partea de recepție a veziculelor de la ER la aparatul Golgi în timp ce Fața Trans a aparatului Golgi este partea de transport a veziculelor umplute cu proteine din aparatul Golgi în alte locuri.
Aparatul Golgi este unul dintre organitele celulare. Prin urmare, este format din vezicule și cisterne. Organulul celular implică sortarea și ambalarea proteinelor intracelular înainte de a fi transportate într-un alt loc. Reticulul endoplasmatic formează vezicule și predări la aparatul Golgi. Fața cis a aparatului Golgi primește vezicule și se unesc pentru a forma cisterne cis. Cisternae se maturizează și se deplasează în direcția cis spre fața trans. De pe fața trans a aparatului Golgi, veziculele pleacă din aparatul Golgi transportând proteine specifice în alte locuri.