Diferența cheie între Prostaglandina E1 și E2 este că prostaglandina E1 (PGE1) este un factor antiinflamator, în timp ce Prostaglandina E2 (PGE2) este un factor pro-inflamator.
Prostaglandinele sunt compuși derivați de lipide care au o funcție asemănătoare hormonilor. Aceștia pot acționa ca compuși autocrini sau paracrini provocând efecte antagonice sau sinergice în organismele vii. Prostaglandina E1 și prostaglandina E2 sunt două tipuri și diferă în ceea ce privește funcționalitatea inflamației. Ambele prostaglandine E1 și E2 aparțin aceleiași familii de prostaglandine E2, iar baza lor de reacție și efectele lor nu sunt încă complet elucidate. Acestea sunt utilizate în tratamentul diferitelor mecanisme biochimice la ființele vii.