Diferența cheie - Proteomică vs Transcriptomică
Tehnologia omică este o tendință actuală, în care diferitele biomolecule ale unui organism sunt privite ca o colecție întreagă în ceea ce privește proprietățile și funcțiile sale. Tehnologia omic are o gamă largă de aplicații. Diferitele omici ale unei probe biologice includ genomică, proteomică, transcriptomică și metabolomică. Proteomica implică studiul complet al tuturor proteinelor dintr-un organism viu. Este definit ca ansamblul tuturor proteinelor exprimate într-un organism, proprietăților sale structurale și funcționale. Prin urmare, setul complet de proteine formează proteomul. Transcriptomica este studiul complet al tuturor moleculelor de ARN mesager (ARNm) prezente într-un organism viu. Astfel, transcriptomica se ocupă de genele care sunt exprimate activ într-un organism viu. Setul total de ARNm dintr-un organism viu este denumit transcriptom. Diferența cheie între proteomică și transcriptomică se bazează pe tipul biomoleculei. În proteomică, se studiază setul total de proteine exprimate într-un organism viu, în timp ce, în transcriptomică, este studiat ARNm total al unui organism viu.
CUPRINS
1. Prezentare generală și diferența cheie
2. Ce este Proteomica
3. Ce este Transcriptomica
4. Asemănări între Proteomică și Transcriptomică
5. Comparație alăturată - Proteomică vs Transcriptomică în formă tabelară
6. Rezumat
Ce este Proteomica?
Termenul de proteomică a fost inventat în anul 1995 și a fost inițial definit ca complementul proteic total dintr-o celulă, țesut sau organism. Odată cu progresul în studiile proteomice, a fost apoi modificat pentru a fi considerat ca un termen umbrelă în care au fost incluse multe domenii de studiu. În prezent, sub tema proteomică, sunt studiate structura, orientarea, funcțiile, interacțiunile sale, modificările sale, aplicațiile sale și importanța proteinelor. Prin urmare, în prezent sunt efectuate multe cercetări în domeniul proteomicii.
Primele studii proteomice au fost făcute pentru a identifica conținutul de proteine din Escherichia coli. Cartarea conținutului total de proteine a fost făcută folosind geluri bidimensionale (2D). După reușita acestui lucru, oamenii de știință au trecut la caracterizarea conținutului total de proteine la animale, cum ar fi cobai și șoareci. În prezent, cartografierea proteinelor umane se face folosind electroforeza pe gel 2D.
Aplicații ale Proteomicii
Există multe avantaje ale studierii proteomicii, deoarece proteinele sunt moleculele care guvernează cea mai mare parte a activității datorită proprietății catalizatorului proteinelor. Astfel, studiul proteinelor întregi poate furniza informații cu privire la starea de sănătate a unui organism. Unele aplicații sunt;
- Adnotarea genomului: Prin studierea conținutului de proteine ale unui organism, se pot determina exact genomii responsabili pentru compusul proteic activ. În acest scenariu rezultatele din toată genomica, Transcriptomica și proteomica sunt importante.
- Identificarea bolii / Diagnosticul: Proteomica este utilizată în identificarea stării bolii, prin compararea celor sănătoși cu cei bolnavi
- Realizarea expresiei proteinelor studiate în timpul experimentării.
- Modificări ale proteinelor și studii de interacțiune: Pentru a utiliza proteinele în condiții vitro sau in vivo, pentru a decide condițiile de depozitare a acestor proteine extrase și pentru a studia comportamentul proteinei în metode in vitro, in vivo și in-silico.
Figura 01: Proteomică
Există diferite tehnici implicate în proteomică
- Extragerea proteinei totale și separarea proteinelor utilizând electroforeza în gel 2D. Proteinele pot fi, de asemenea, separate prin cromatografie lichidă de înaltă performanță (HPLC).
- Secvențierea proteinelor extrase folosind metode precum metoda de secvențiere a lui Edmund sau spectrometria de masă.
- Odată ce secvențele sunt identificate, proprietățile structurale și funcționale ale conținutului de proteine sunt analizate folosind software-ul computerizat și instrumentele de bioinformatică.
Ce este Transcriptomica?
Termenul transcriptom este inventat recent. Transcriptomica este studiul conținutului total de ARNm al unui organism. ARNm total este ADN-ul exprimat într-un organism viu sau o celulă. Colecția completă de ARNm este denumită transcriptom.
Pașii către analiza transcriptomului includ,
- Extracția ARN-ului, separarea ARNm utilizând cromatografia pe coloană pe gel cu bile poli DT.
- Se face secvențierea ARNm.
Tehnologia microarray este un mod comun de identificare a transcriptomului unui organism. Tehnica microarray implică o placă de sondă cu firele complementare ale transcriptomului. La hibridizare, ARNm prezent în organism sau celule poate fi caracterizat.
Figura 02: Tehnici transcriptomice
Transcriptomica este acum utilizată pe scară largă în domeniul medical. Diagnosticul bolilor și profilarea bolilor sunt principalele domenii în care este utilizată Transcriptomica. Prin analiza unui transcriptom al unui organism, se poate identifica ARNm străin și, dacă există infecții, acesta poate fi identificat. ARN necodificator poate fi separat folosind tehnologii transcriptomice. Și, de asemenea, expresia genelor sub diferite stresuri de mediu poate fi monitorizată.
Care sunt asemănările dintre proteomică și transcriptomică?
- Ambele fac parte din conceptul de tehnologie omică.
- Ambele sunt utilizate în diagnosticarea bolii și în caracterizarea bolii unui organism.
- Ambele zone de studiu au implicat extragerea biomoleculei, separarea biomoleculei și etapele de secvențiere.
Care este diferența dintre proteomică și transcriptomică?
Difuzarea articolului din mijloc înainte de tabel
Protemics vs Transcriptomics |
|
| Proteomica implică studiul complet al tuturor proteinelor dintr-un organism viu. | Transcriptomica este studiul complet al tuturor moleculelor de ARN mesager (ARNm) prezente într-un organism viu. |
| Am studiat tipul de molecule bio | |
| Proteinele sunt studiate în proteomică. | ARNm sunt studiați în transcriptomică. |
| Factori studiați | |
| Structura, funcția, interacțiunile, modificările și aplicațiile proteinelor sunt studiate în proteomică. | Structura secvenței, interacțiunile cu mediul și aplicațiile ARNm sunt studiate în transcriptomică. |
Rezumat - Proteomică vs Transcriptomică
Omics joacă un rol important în domeniul științelor vieții. Proteomica se referă la studiul proteomului care formează colecțiile complete de proteine dintr-o celulă sau un organism. Transcriptomica se referă la studiul transcriptomului, care este setul complet de ADN exprimat, care este sub formă de ARNm. Cele două domenii de studiu, proteomica și transcriptomica, au fost derivate după introducerea genomicii și utilizate în prezent pe scară largă în diagnosticul medical și în caracterizarea și screeningul organismelor. Aceasta este diferența dintre proteomică și transcriptomică.
Descărcați PDF-ul Proteomics vs Transcriptomics
Puteți descărca versiunea PDF a acestui articol și o puteți folosi în scopuri offline conform notei de citare. Vă rugăm să descărcați versiunea PDF aici: Diferența dintre proteomică și transcriptomică
