Diferența cheie între tiocianat și izotiocianat este că tiocianatul este o grupă funcțională în care gruparea alchil sau arii este atașată prin atomul de sulf, în timp ce izotiocianatul este izomerul de legătură al tiocianatului în care gruparea alchil sau arii este atașată prin atomul de azot.
Tiocianatul și izotiocianatul sunt grupări funcționale care conțin atomi de carbon, azot și sulf. Aceste grupuri funcționale au aceeași conectivitate a atomilor. Adică, atomul de carbon se află în mijloc, în timp ce atomii de azot și sulf sunt atașați de laturile sale. Cu toate acestea, legătura chimică dintre acești atomi este diferită una de cealaltă.
