Diferența cheie dintre anammox și denitrificare este că anammox se referă la oxidarea anaerobă a amoniului, care transformă amoniul și nitriții în azot gazos în condiții anoxice. Intre timp, in timp ce denitrificare este transformarea biologică a azotatului în N 2 de bacteriile denitrificatoare.
Ciclul azotului este un ciclu biogeochimic important în care azotul este transformat în diferite forme chimice, cum ar fi NH 3, NH 4 +, NO 2 -, NO 3 -etc. Există patru procese majore observate în ciclul azotului. Acestea sunt fixarea, amonificarea, nitrificarea și denitrificarea. Multe dintre aceste procese sunt efectuate de microorganisme, în special bacterii prezente în sol. Anammox este una dintre cele mai recente adăugiri la ciclul azotului. Este procesul de oxidare anaerobă a amoniului. Un grup specific de bacterii cunoscut sub numele de planctomicete efectuează acest proces. Aceștia posedă un organet special numit anamoxozomi, care oferă locul reacției anamox. Cu toate acestea, în cele din urmă, atât denitrificarea, cât și anammoxul produc azot gazos.
